文献によるセミナー
2012年1月現在
学術文献を用いたセミナー（文献紹介）の目的は研究室ごとに多様です。原著論文で使われた実験手法原理や詳細な内容の理解、つまり精読することは、基礎的スキルとして必要です。けれども、どんなに優れた論文も、原理説明や全訳に終始するならば各自が手の空いた時間に読めば済むことです。例えば皆さんが企業や研究所などに就職すれば、ジャーナルクラブ等と呼ばれる新着論文の幅広い領域の情報のまとめが紹介されるスタイルや、特定のプロジェクト内容に限定した情報共有を主目的としたスタイル、ある研究領域の専門家が最近の研究状況と展望を含めて他分野研究者に紹介する実践的な情報共有の機会に触れることでしょう。
私達の研究室には学部3-4年生から博士過程大学院生までが所属し、全室員が時間を共有する（他人の研究時間を自分の発表を聴くために費やしてもらう）ことから、著者の主張をそのまま紹介するのではなく、発表者自身の視点や考えを提唱するセミナーを行っています。例えば、発表に慣れてきた修士や博士の学生ならば、紹介する論文の論理的批判や、ある分野の問題点を指摘するような威勢のよい発表に挑戦するのもよいでしょう。発表者は自分が伝えたいことを、他人の論文結果等を利用して主張し、一方で、聴き手はそれに対する質問や意見を述べセミナーのディスカッションをを盛り上げることが求められます。自然科学ではシェア（共有）の精神が大切にされ、他人の考えや情報を一方的に享受する姿勢はフェアではないためです。セミナーの対象は、個人や研究室全体のプロジェクトに関連する必要はなく、自然科学のどの研究領域を扱っても構いません。また、若い学生には、紹介する論文の数が多いセミナーが良い発表と感じることがあるかもしれませんが、そうではありません。紹介する論文は、あくまでも、各自がセミナーで主張したいことの根拠や背景の理解、利用する技術の理解に必要な範囲で利用すればよいのです。また、個々の実験結果の説明には、当該実験の目的、実験原理と判断基準、得られた結果とそこから論理的に導かれる考察の要素が必要であることは言うまでもなく、これは、各自が研究室で取り組むプロジェクト進行と同じです。複数の論文を紹介する場合には、それぞれで得られた実験結果の組み合わせにより、発表者自身が考える結果とその考察を加えて、各自の意見や主張を展開する必要があるでしょう。
2011年度（日付の新しい順に記載） 発表タイトルと本論に用いた主要論文を示します。
後期
The double-stranded RNA-activated protein kinase, an immune molecule which has a link with memoty
・Cell 477, 95-99147, 1384-1396 (2011)
Role of MyD88-independent innate immunity to maintain the gut microbiota
・Science 334, 205- (2011)
Study mechanisms of valproic acid-induced neural tube defects
・Mol. Pharmacol. 80, 979-987 (2011)
HIV感染細胞同士の膜融合による薬剤耐性の発揮
・Proc. Natl. Acad. Sci. USA 106, 9403-9408 (2009), Nature 477, 95-99 (2011)
細胞膜損傷を修復する分子機構
・J. Cell Biol. 180, 905-914 (2008), J. Cell Biol. 189, 1027-1038 (2010),
細胞競合過程ではどのようにして一方の細胞が活性化するか
・Dev. Cell 20, 315-328 (2011), J. Cell Sci. 123, 171-180 (2009)
細菌病原性因子による宿主免疫調節に関する新たな仕組みの存在
・Traffic 12, 579-590 (2011), Immunity 35, 536-549 (2011)
人工遺伝子コードの創成-合成生物学の可能性-
・Nat. Biotechnol. 20, 177-182 (2002), Science 333, 1151-1154 (2011)
背が高い人は癌になりやすい
・Lancet Oncol. 12, 785-794 (2011)
PoliU tail of rho-independent terminator is requred for function of Hfq
・Proc. Natl. Acad. Sci. USA 108, 13059-13064 (2011)
Nrf2を標的とした乳がん治療の限界
・J. Biol. Chem. 286, 32115-32122 (2011), Mol. Cancer Ther. 8, 2432-2440 (2009), Cancer Res. 68, 1303-1309 (2008)
遠く離れた神経細胞間におけるシナプス形成を解析するためのツール
・Nauron 53, 369-374 (2007), Neuron 67, 562-574 (2010), Nature 472, 191-196 (2011)
免疫における貪食過程の機械学的な解析
・J. Cell Sci. 124, 1106-1114 (2011)
The role of RNA chaperone Hfq in Eschericia coli virulence and multidrug resistance
・PLos One 6, e16387 (2011), J. Antimicrob. Chemother. 65, 853-585 (2010)
メモリーT細胞の早い免疫応答の仕組みの解明
・Science 295, 338-342 (2002), J. Immunol. 187, 133-140 (2011),
Function of Pseudomonas aeruginosa effector proteins and its export mechanism by type IV secretion system
・Nature 475, 343 (2011),
Increase vitamin A intake and effect of fragile bone in rat
・Bone 48, 496-506 (2011),
核内受容体を標的とした糖尿病治療候補の使い方
・Nature 474, 506-512 (2011), Proc. Natl. Acad. Sci. USA 162, 2058-2062 (2005)
CO2感知機構の恒常的活性化による蚊の吸血対象探索の阻害
・Curr. Biol. 17, 1533-1544 (2007), Nature 474, 87-91 (2011)
前期
アポトーシス細胞が他の細胞の増殖を促す
・Sci. Signal. 3, ra13 (2010), Nat. Med. 17, 860-866 (2011)
好中球の口腔細菌貪食受容体の同定
・J. Peridontal Res. 42, 410-419 (2007), Oral Dis. 14, 327-334 (2008), Mol. Immunol. 2011 (Choi et al. in press)
ミトコンドリアの形質転換
・J. Bioenerg. Biomembr. 36, 387-393 (2004), Hum. Gene Ther. 20, 897-907 (2009), Biochem. Biophys. Res. Commun. 97, 181-186 (2010), Science 314, 471-474 (2006), J. Biol. Chem. 272, 5342-5347 (1997)
太陽光による肌の老化を抑える新たな標的分子
・J. Biol. Chem. 286, 18268-18276 (2011), Exp. Dematol. 18, 431-436 (2009), J. Cell Physiol. 219, 766-775 (2009)
働き蜂が女王蜂になる秘密
・Nature 472, 478 (2011)
HIVへのオートファジーによる防御
・J. Cell Biol. 186, 255-268 (2009), J. Biol. Chem. 286, 18890-18902 (2011), Cell Host Microbe 6, 231-243 (2009)
What does not kill the brain makes it stronger: Iduna, a neuron survival protein
分泌型IgAは腸内細菌に結合して腸上皮への接着を促す
・J. Biol. Chem. 286, 17239-17247 (2011), Gut 38, 348-354 (1996), Immunology 109, 580-587 (2003)
脱分化を伴わない細胞機能の変換
・Cell 117, 663-676 (2004)
Mechanism of EGFR pathway in Drosophila gut homeostasis upon stress conditions
・BMC Biol. 8, 152 (2010), Development 138, 1045-1055 (2011)
The role of B lymphocyte stemulator and the first new lupus drug appoved in 56 years
・J. Immunol. 166, 6-10 (2001), J Clin. Invest. 119, 1066-1073 (2009)
がん治療には化学療法にマクロファージ誘導因子CSF-1の阻害剤を併用すべき
・Cancer Res. 64, 5378-5384 (2004), Cancer Discovery 1, 52-65 (2011)
免疫グロブリン可変領域ドメインを持つ宿主分子を介したエボラウイルスの感染機構の解明
・Proc. Natl. Acad. Sci. USA 108, 8426-8431 (2011), J. Virol. 77, 7539-7544 (2003)
2010年度（日付の新しい順に記載） 発表タイトルと本論に用いた主要論文を示します。
後期
グラム陰性菌の外膜タンパク質によるペリプラズムでのペプチドグリカン合成制御の機構
・Cell, 143, 1097-1190 (2010)
ウイルス様構造物を利用した宿主の感染防御機構
・Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 82, 1490-1493 (1985), J. Viol., 62, 4452-4464 (1988), J. Virol., 61, 1416-1420 (1987), J. Immunol., 186, 73-82 (2011),
20ヒドロキシエクジソンによる安定した個体発生の制御
・Science, 310, 667-670 (2005), Dev. Cell, 18, 1012-1021 (2010), Dev. Cell, 19, 895-902 (2010)
細菌メタファクターによる細胞内寄生細菌の宿主への感染調節
・Cell. Microbiol., 10, 1209-1220 (2008), Curr. Opin. Microbiol., 13, 41-46 (2010), PLoS Pathog., 6, e1001216 (2010)
臓器の大きさを決める仕組み：ショウジョウバエでの研究
・Development, 126, 1091-1101 (1999), Nat. Rev. Genet., 7, 907-916 (2006), Dev. Biol., 321, 18-26 (2008), Curr. Biol., 20, 458-463 (2010), PLoS Biol., 8, e1000566 (2010)
糖尿病治療における膵ランゲルハンス島移植療法の成功率向上
・Diabetologia, 52, 145-153 (2009), Nat. Immunol., 11, 897-904 (2010)
Tubulin deglutamylaseの発見
・J. Biol. Chem., 285, 22936-22941 (2010), J. Biol. Chem., 283, 3915-3922 (2008)
RNA分解酵素Dicerの機能変換による細胞内での新たな働き
・Science, 328, 327-334 (2010)
Myeloid-derived supressor cells: A new potential target for cancer therapy
・J. Immunol., 176, 284-290 (2006), Eur. J. Immunol., 40, 3347-3357 (2010)
乳がんに対する新たな治療薬開発の可能性
・Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 107, 18628-18633 (2010), J. Biol. Chem., 277, 20336-20342 (2002)
テロメアが細菌感染時の過剰な免疫応答を抑制する
・J. Immunol., 171, 1393-1400 (2003), J. Biol. Chem., 285, 28806-2811 (2010), PLos One, 5, e11873 (2010)
良薬は肺に苦し-苦み受容体の作用を利用した呼吸器疾患治療の可能性-
・Nat. Med., 16, 1299-1304 (2010)
Mechanism of DesK/DesR in cold thermosensing and controlling of membrane fluidity in Bacillus subtilis
・J. Bacteriol., 186, 2655-2663 (2004), J. Biol. Chem., 279, 39340-39347 (2004), Curr. Biol., 20, 1539-1544 (2010)
Adaptor protein is essential for insect cytokine signaling hemocytes
・Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 107, 15862-15867 (2010)
細菌を使った効率の良いがん細胞の殺し方-好中球の制御が重要-
・PLoS One, 4, e6692 (2009), Cancer Res., 68, 2952-2960 (2008)
多機能性T細胞HOZOT細胞は臨床応用可能か
・J. Clin. Immunol., 32, 223-230 (2009), Exp. Hematol., 37, 1454-1463 (2009), J. Mol. Cell Biol., 2, 139-151 (2010)
共生細菌による宿主オス殺しの意義と仕組みの解析
・BMC Biol., 5, 9 (2007), J. Invertebr. Pathol., 105, 145-150 (2010), Science, 307, 1461-1463 (2005)
細胞競合(cell competition)ではどのようにして一方の細胞が死ぬのか
・Dev. Cell, 16, 458-495 (2009), Cancer Sci., 97, 1217-1225 (2006)
細菌の免疫回避・薬剤耐性を導く機構を説明する最近の知見
・ProS Pathog., 6, e1000989 (2010),Nature, 467, 82-86 (2010), Mol. Cell, 37, 311-320 (2010), Microb. Pathog., 49, 174-180 (2010)
遺伝子発現の偶発性：遺伝的に同一な細胞に個性を生み出す仕組み
(Stochastic gene expression: a mechanism for generating individuality amoung cells with identical genetic background)
・Cell, 135, 216-226 (2008), Science, 329, 533-538 (2010)
TTR-52タンパク質は橋渡し分子として線虫アポトーシス細胞の貪食作用に働く
・Nat. Cell Biol., 12, 655-664 (2010)
Quorum sensing and multi-drug resistance in Escherichia coli: Link between quorum sensing protein regulation and multidrug resistance transpoter
・Mol. Microbiol., 43, 677-685 (2002), Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 103, 2386-2391 (2006), J. Antimicrob. CHemother., 65, 1178-1186 (2010)
インテグリンのリガンド結合についての新事実
・J. Biol. Chem., 185, 17604-17613 (2010), J. Cell Biol., 168, 1109-1118 (2005), Cell, 59, 185-195 (1999), J. Cell. Biochem., 102, 211-223 (2007)
人工的血管作成の実現
・J. Biol. Chem., 282, 12707-12716 (2007),Circulation, 122, 910-919 (2010)
前期
Helicobacter pylori exploits host membrane phosphatidylserine for delivery, localization and pathophysiological action of the CagA oncoprotein
・Cell Host Microbe, 7, 399-411 (2010)
Involvement of Integrin in phagocytosis of apoptotic cells in C. elegans
・Curr. Biol., 20 477-486 (2010)
細菌が持つ多剤排出トランスポーターを介した宿主免疫の誘導
・Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 105, 10191-10196 (2008), Science, 328, 1703-1705 (2010)
社会問題を解決する人工生物-２-
・Science, 329, 52 (2010)
脂質輸送タンパク質による形質膜と細胞内小器官膜管での脂質輸送機構の解明
・Biochim. Biophys. Acta, 1687, 130-140 (2005), J. Cell Biol., 173, 107-119 (2006), J. Cell Biol., 187, 889-903 (2009)
ショウジョウバエにおける新たな遺伝子発現制御システムの確立
・Cell, 141, 536-548 (2010), Neuron, 22, 451-461 (1999)
要除去自己核酸の出現と全身性エリテマトーデス発症と病態変化のしくみ
・J. Immunol., 182, 1982-1991 (2009), Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 107, 9813-9818 (2010), Immunol. Rev., 223, 271-283 (2008), Nature, 465, 937-942 (2010)
理論的に存在が予想されていた体表模様決定因子（モルホゲン）の同定
・Sem. Cell Dev. Biol., 20, 82-89 (2009), Nature, 464, 1143-1148 (2010)
チェディアック・東症候群における免疫機能低下機構の手がかり
・J. Immunol., 154, 6122-6131 (1995), Nat. Immunol., 11, 495-502 (2010)
DNA複製と独立したDNA脱メチル化の仕組み
・Develop. Biol., 241, 172-182 (2002), EMBO J., 29, 1877-1888 (2010)
TNFの糖質コルチコイド産生による抗炎症効果
・J. Exp. Med., 207, 1057-1066 (2010)
常在細菌そうの組成が宿主の体質を支配する
・Proc. Natl. Acad. Sci. USA., 102, 11070-11075 (2005), Nature, 444, 1027-1031 (2006), Nat. Med., 16, 228-231 (2010)
精神疾患の治療における新たなターゲット
・Neuron, 33, 23-24 (2002), Cell, 141, 775-785 (2010)
フローラによる全身性の免疫腑活作用
・PLoS Pathg., 1, e1 (2005), PLoS Pathg., 3, e118 (2007), Nat. Med., 16, 228-232 (2010), Am. J. Respir. Cell. Mol. Biol., 39, 536-542 (2008), Cell, 122, 107-118 (2005)
サイトメガロウイルスは有効なワクチンとなる
・Science, 328, 102-106 (2010), Nat. Med., 15, 293-299 (2009)
細菌のバイオフィルム形成における細胞外DNAの役割の解明
・Science, 295, 1487 (2002), Mol. Microbiol., 75, 1355-1371 (2010)
生殖幹細胞を用いたES細胞作成
・Nature, 440, 1199-1202 (2006), Nature, 456, 344-349 (2018), Hum. Reprod., 25, 158-167 (2010), Science, 328, 62-67 (2010), Nature, 456, 599-604 (2008)
グラム陰性細菌外膜小胞による宿主感染免疫の活性化機構と応用研究への可能性
・Microbiol. Mol. Biol. Rev., 74, 81-94, (2010), Cell. Microbiol., 12, 372-385 (2010), J. Immunol., 183, 8099-8109 (2009), PLoS Pathg., 6, e1000724 (2010), Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 107, 3099-3104 (2010)
サリドマイド催奇形性の仕組みの解明
・Nat. Med., 5, 582-585, (1999), Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 91, 4082-4085 (1994), Science, 327, 1345-1350 (2010)